728x90 반응형 r 프로그램2 Heatmap, GO Plot, KEGG Plot 1. Heatmap이란?Heatmap(히트맵)은 데이터 행렬을 색상으로 표현하여 값의 패턴을 시각적으로 쉽게 파악할 수 있는 방법입니다. 유전자 발현 데이터 분석에서 흔히 사용되며, 특정 조건에서 유전자들의 발현 변화 패턴을 확인할 수 있습니다. Heatmap 생성 코드 분석library('pheatmap')df_Fc2 코드 설명df_Fn 데이터를 df_Fc2로 복사행 이름을 유전자 이름(name)으로 설정특정 샘플(Control1, Control2, ...)만 선택하여 데이터프레임 갱신각 유전자의 발현 값을 min-max 정규화하여 -1~1 범위로 조정pheatmap 패키지를 사용해 히트맵 생성 아래와 같이 유전자 발현 양상을 한 눈에 볼 수 있습니다. 2. GO(Gene Ontology) .. 2025. 2. 1. miRNA 데이터 분석 및 시각화 miRNA 발현 데이터를 분석하는 R 코드를 정리해보았습니다. 0. 필요 함수 불러오기library(readxl)library(clusterProfiler) library(tidyverse) 1. 데이터 불러오기setwd("C:/Users/abc/Desktop") # 작업 디렉토리 설정 설명:setwd() 함수는 작업 디렉토리를 설정하는 함수입니다.데이터를 불러올 디렉토리를 지정해야 파일을 찾을 수 있습니다.일반적으로는 같은 위치에 저장된 파일은 그냥 불러올 수 있습니다.data 설명:read.csv() 함수는 CSV 파일을 읽어 데이터프레임으로 변환합니다.header=TRUE 옵션은 첫 번째 행을 열 이름으로 사용하도록 지정합니다. 2. 그룹 나누기Group1 설명:데이터프레임의 특.. 2025. 2. 1. 이전 1 다음 728x90 반응형
