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STRING: Functional Protein Association Networks STRING is a database that provides information on known and predicted protein-protein interactions. These interactions include both direct (physical) interactions and indirect (functional) associations, derived from computational predictions, transfers of knowledge between organisms, and interactions collected from other (primary) databases.Protein-protein interaction networks are crucial for un..
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ImageJ를 이용한 이미지 분석: 전처리부터 정량 분석까지 현미경 이미지나 세포 사진을 분석할 때 ImageJ는 연구자들에게 필수적인 도구입니다. 오늘은 데이터의 노이즈를 줄이고, 정확하게 입자를 측정할 수 있는 표준화된 분석 워크플로우를 소개해 드리겠습니다. 1. 이미지 전처리 (노이즈 제거 및 최적화)정확한 수치를 얻기 위해서는 먼저 이미지의 상태를 최적화해야 합니다. 제가 사용한 설정값은 다음과 같습니다.채널 분리 (Split Channels): 다채색 이미지의 경우 분석하고자 하는 채널을 분리합니다. 이번 분석에서는 Green 채널을 사용했습니다.배경 제거 (Subtract Background): 'Rolling ball' 알고리즘을 사용하며, 반지름(Radius)은 50으로 설정하여 불균일한 배경 조명을 제거했습니다.가우시안 블러 (Gaussian ..
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[Guide] How to Predict miRNA Target Genes using TargetScan TargetScan is one of the most widely used bioinformatics tools for predicting the biological targets of miRNAs. It searches for sites that match the seed region of each miRNA and provides ranked predictions based on scientific scores. 1. What is TargetScan?Developed by the David Bartel lab, TargetScan provides regularly updated predictions across various species. It is highly regarded for its a..
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Primer 짜는 방법 (NCBI) NCBI(National Center for Biotechnology Information)에서 우리에게 필요한 Primer를 짜는 방법에 대해서 간단히 정리해보려 합니다. 우선, NCBI에 접속을 합니다. 주소는 아래와 같습니다.https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ National Center for Biotechnology Information www.ncbi.nlm.nih.gov 그럼, 아래와 같은 화면이 나옵니다. 저는 mRNA를 활용한 실험에 필요한 Primer를 짤 계획이기 때문에, 오른쪽의 항목들 중 'Nucleotide'를 선택하여 들어갔습니다. 그리고 검색창에 Primer를 짜고 싶은 대상을 검색해줍니다. 저의 경우에는, 사람에게 나타나는 gene을 대상으로 만들 계..
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교두 (cusp) 치아의 치관에 존재하는 튀어나온 부위(융기부, prominence) 중, '교두'에 대해서 알아보겠습니다. 교두(cusp)은 구치들의 교합면에서 작은 산봉우리처럼 튀어나온 부분을 의미합니다. 일반적으로 교두는 4개의 융선을 갖는 피라미드형을 보이며, 그 끝은 교두정(cusp tip)이라고 합니다. 교두정은 교두에서 가장 높은 부분을 의미합니다. 그리고 일반적으로 아래의 빨간 선과 같이 각 교두에는 4개의 융선을 가짐니다. (3개의 융선을 가질수도 있음) 아래의 그림은 상악제1소구치의 교두(협측교두, 설측교두)를 나타내는 그림입니다. 위쪽의 협측교두의 경우에는 일반적인 경우와 같이 교두융선이 4개가 존재하는 것을 볼 수 있습니다. 협측교두정에서 4방향으로 생기는 융선은 buccal cusp ridg..
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2023년 하반기 지원 후기 - 삼정KPMG (삼정회계법인) 2023년 하반기에 삼정회계법인(삼정 KPMG)의 공고를 보게 되어 지원을 하게 되었습니다. 당시 공고는 아래와 같았는데, 저는 회계사 자격증이 없었기 때문에 컨설팅 업무로 지원을 하게 되었습니다. (그리고 제가 알기론 회계사를 채용하는 시기와 컨설턴트를 채용하는 시기가 다릅니다.) 사실 컨설팅에 관심을 가지게 된지 얼마 되지 않았었고, 관련해서 준비한 것은 특별히 없었지만 도전을 해보고 싶어 지원을 하였습니다. 삼정KPMG에는 회계업무를 주로 수행하는데, 컨설팅을 하는 부서도 함께 존재합니다. 그렇기 때문에 모르시는 분들도 많은 것 같습니다. 컨설팅은 보통 BIG3라 불리는 MBB가 가장 유명한 것으로 알고 있습니다. 그 다음으로는 보통 회계법인 BIG4라고 불리는 삼일(PwC), 삼정(KPMG), ..
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구강생화학: 타액 타액선의 해부학적 구조1. 대타액선 (Major Salivary Glands)이하선 (Parotid Gland):장액성 선포세포로 구성제9 뇌신경(설인신경) 지배외경동맥에서 혈액 공급특징: 귀 아래 위치, 씹을 때 활성화악하선 (Submandibular Gland):장액성, 점액성 선포세포 혼재제7 뇌신경(안면신경) 지배안면동맥, 설동맥에서 혈액 공급특징: 턱 아래 위치, 안정시 타액 대부분을 생산설하선 (Sublingual Gland):장액성, 점액성 선포세포 혼재제7 뇌신경(안면신경) 지배설하동맥, 이하동맥에서 혈액 공급특징: 혀 아래 위치, 점성 타액 분비2. 소타액선 (Minor Salivary Glands)구개선, 협선, 순선, 설선, 후구선으로 구성점액성 선포세포로 구성설선, 후구선 일부는 제..
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ImageJ를 이용한 이미지 분석: 전처리부터 정량 분석까지 현미경 이미지나 세포 사진을 분석할 때 ImageJ는 연구자들에게 필수적인 도구입니다. 오늘은 데이터의 노이즈를 줄이고, 정확하게 입자를 측정할 수 있는 표준화된 분석 워크플로우를 소개해 드리겠습니다. 1. 이미지 전처리 (노이즈 제거 및 최적화)정확한 수치를 얻기 위해서는 먼저 이미지의 상태를 최적화해야 합니다. 제가 사용한 설정값은 다음과 같습니다.채널 분리 (Split Channels): 다채색 이미지의 경우 분석하고자 하는 채널을 분리합니다. 이번 분석에서는 Green 채널을 사용했습니다.배경 제거 (Subtract Background): 'Rolling ball' 알고리즘을 사용하며, 반지름(Radius)은 50으로 설정하여 불균일한 배경 조명을 제거했습니다.가우시안 블러 (Gaussian ..
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융선 (ridge) 치아의 치관에서 선 모양으로 솟아 있는 부분을 '융선'이라고 합니다. [교두융선 (cusp ridge)] 견치나 구치의 각 교두정에서 협/설/근/원심측으로 주행하는 융선을 의미합니다. 참고로, 상악 제1대구치의 교두는 4개이고, 하악 제1대구치의 교두는 5개 입니다. [삼각융선 (triangular ridge)] 구치의 주요 교두정에서 교합면의 중심부로 내려오는 삼각형 모양의 융선을 의미합니다. 참고로, 상악 제1소구치의 교두는 2개입니다. 그리고 아래 그림처럼 두 개의 삼각융선이 이어지는 것을 '연합융선'이라고 부르기도 합니다. 또한, 협측 교두(buccal cusp)에서 나오는 설측교두융선(lingual cusp ridge)와 그림의 협측삼각융선(buccal triangular ridge)는..
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