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STRING: Functional Protein Association Networks STRING is a database that provides information on known and predicted protein-protein interactions. These interactions include both direct (physical) interactions and indirect (functional) associations, derived from computational predictions, transfers of knowledge between organisms, and interactions collected from other (primary) databases.Protein-protein interaction networks are crucial for un..
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ImageJ를 이용한 이미지 분석: 전처리부터 정량 분석까지 현미경 이미지나 세포 사진을 분석할 때 ImageJ는 연구자들에게 필수적인 도구입니다. 오늘은 데이터의 노이즈를 줄이고, 정확하게 입자를 측정할 수 있는 표준화된 분석 워크플로우를 소개해 드리겠습니다. 1. 이미지 전처리 (노이즈 제거 및 최적화)정확한 수치를 얻기 위해서는 먼저 이미지의 상태를 최적화해야 합니다. 제가 사용한 설정값은 다음과 같습니다.채널 분리 (Split Channels): 다채색 이미지의 경우 분석하고자 하는 채널을 분리합니다. 이번 분석에서는 Green 채널을 사용했습니다.배경 제거 (Subtract Background): 'Rolling ball' 알고리즘을 사용하며, 반지름(Radius)은 50으로 설정하여 불균일한 배경 조명을 제거했습니다.가우시안 블러 (Gaussian ..
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[Guide] How to Predict miRNA Target Genes using TargetScan TargetScan is one of the most widely used bioinformatics tools for predicting the biological targets of miRNAs. It searches for sites that match the seed region of each miRNA and provides ranked predictions based on scientific scores. 1. What is TargetScan?Developed by the David Bartel lab, TargetScan provides regularly updated predictions across various species. It is highly regarded for its a..
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2023년 하반기 지원 후기 - 삼정KPMG (삼정회계법인) 2023년 하반기에 삼정회계법인(삼정 KPMG)의 공고를 보게 되어 지원을 하게 되었습니다. 당시 공고는 아래와 같았는데, 저는 회계사 자격증이 없었기 때문에 컨설팅 업무로 지원을 하게 되었습니다. (그리고 제가 알기론 회계사를 채용하는 시기와 컨설턴트를 채용하는 시기가 다릅니다.) 사실 컨설팅에 관심을 가지게 된지 얼마 되지 않았었고, 관련해서 준비한 것은 특별히 없었지만 도전을 해보고 싶어 지원을 하였습니다. 삼정KPMG에는 회계업무를 주로 수행하는데, 컨설팅을 하는 부서도 함께 존재합니다. 그렇기 때문에 모르시는 분들도 많은 것 같습니다. 컨설팅은 보통 BIG3라 불리는 MBB가 가장 유명한 것으로 알고 있습니다. 그 다음으로는 보통 회계법인 BIG4라고 불리는 삼일(PwC), 삼정(KPMG), ..
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ImageJ를 이용한 이미지 분석: 전처리부터 정량 분석까지 현미경 이미지나 세포 사진을 분석할 때 ImageJ는 연구자들에게 필수적인 도구입니다. 오늘은 데이터의 노이즈를 줄이고, 정확하게 입자를 측정할 수 있는 표준화된 분석 워크플로우를 소개해 드리겠습니다. 1. 이미지 전처리 (노이즈 제거 및 최적화)정확한 수치를 얻기 위해서는 먼저 이미지의 상태를 최적화해야 합니다. 제가 사용한 설정값은 다음과 같습니다.채널 분리 (Split Channels): 다채색 이미지의 경우 분석하고자 하는 채널을 분리합니다. 이번 분석에서는 Green 채널을 사용했습니다.배경 제거 (Subtract Background): 'Rolling ball' 알고리즘을 사용하며, 반지름(Radius)은 50으로 설정하여 불균일한 배경 조명을 제거했습니다.가우시안 블러 (Gaussian ..
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치아의 이름 및 표기법 [치아 이름] 각 치아의 이름은 '상/하악 - 좌/우측 - 영구치/유치 - 치아 이름'의 순서로 부릅니다. 예를 들면, '상악 우측 중절치', '상악 우측 유중절치'와 같이 부르게 됩니다. 영어로 부르는 경우에는 '(permanent) maxillary right central incisor', 'primary maxillary right central incisor'와 같이 부르고 표기하게 됩니다. 영어와 한글의 순서에 약간의 차이가 있음을 알 수 있습니다. [치아 이름 약호 표시] 치아의 이름은 위에 언급한 것과 같이 불러야 하며, 그 이름은 상당히 길다고 느껴질 수 있습니다. 그래서 이름에 혼동이 올 수도 있으며, 진료 시 진료기록부에 표기하거나 이름을 부르는 시간이 오래 걸리는 등의 불편함도..
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치아의 기능 및 구조 [치아 기능] 일반적으로 인간의 치아는 다음 세종류의 기능이 있습니다.저작 (mastication)발음 (phonation)심미 (esthetics) [치아 구조] 치아는 크게 치관과 치근으로 구성되어 있습니다. 치관은 입안에서 직접 볼 수 있는 부분으로 가장 겉은 사기질로 싸여있습니다. 치관은 치아의 일반적 기능인 저작, 발음, 심미를 담당합니다. 각 치아별로 다양한 모양을 가집니다. 치관은 해부학적 치관과 임상적 치관의 서로 다른 기준에서 바라본 두 가지의 정의가 있습니다.해부학적 치관 (anatomical crown): 사기질(enamel)에 싸여 있는 치관으로, 치경선(cervical line)의 위쪽을 뜻합니다.임상적 치관 (clinical crown): 치은선(gingival li..
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치아의 분류 및 명칭 [맹출 시기에 따른 분류] 치아는 맹출 시기에 따라 '유치'와 '영구치'로 구분합니다. 유치는 영어로 'milk teeth' 라고 부르며, primary teeth, baby teeth, milk teeth, temporary teeth와 같이 여러가지 이름으로 불립니다. 생후 6개월부터 나오며 일악편측에 5개씩 총 20개로 이루어집니다. 성장과 함께 빠지기 때문에 탈락치(deciduous teeth)라고도 합니다. 영구치는 생후 6년부터 나오며 일악편측에 8개씩 총 32개로 이루어집니다. 유치가 빠진 자리에 나오는 20개의 영구치를 대생치 혹은 계승치(succedaneous teeth / successional teeth)라고 하며, 유치의 원심 쪽(입술과 먼 안쪽)에서 새로 나오는 12개의..
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Primer 짜는 방법 (NCBI) NCBI(National Center for Biotechnology Information)에서 우리에게 필요한 Primer를 짜는 방법에 대해서 간단히 정리해보려 합니다. 우선, NCBI에 접속을 합니다. 주소는 아래와 같습니다.https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ National Center for Biotechnology Information www.ncbi.nlm.nih.gov 그럼, 아래와 같은 화면이 나옵니다. 저는 mRNA를 활용한 실험에 필요한 Primer를 짤 계획이기 때문에, 오른쪽의 항목들 중 'Nucleotide'를 선택하여 들어갔습니다. 그리고 검색창에 Primer를 짜고 싶은 대상을 검색해줍니다. 저의 경우에는, 사람에게 나타나는 gene을 대상으로 만들 계..
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