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STRING: Functional Protein Association Networks STRING is a database that provides information on known and predicted protein-protein interactions. These interactions include both direct (physical) interactions and indirect (functional) associations, derived from computational predictions, transfers of knowledge between organisms, and interactions collected from other (primary) databases.Protein-protein interaction networks are crucial for un..
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ImageJ를 이용한 이미지 분석: 전처리부터 정량 분석까지 현미경 이미지나 세포 사진을 분석할 때 ImageJ는 연구자들에게 필수적인 도구입니다. 오늘은 데이터의 노이즈를 줄이고, 정확하게 입자를 측정할 수 있는 표준화된 분석 워크플로우를 소개해 드리겠습니다. 1. 이미지 전처리 (노이즈 제거 및 최적화)정확한 수치를 얻기 위해서는 먼저 이미지의 상태를 최적화해야 합니다. 제가 사용한 설정값은 다음과 같습니다.채널 분리 (Split Channels): 다채색 이미지의 경우 분석하고자 하는 채널을 분리합니다. 이번 분석에서는 Green 채널을 사용했습니다.배경 제거 (Subtract Background): 'Rolling ball' 알고리즘을 사용하며, 반지름(Radius)은 50으로 설정하여 불균일한 배경 조명을 제거했습니다.가우시안 블러 (Gaussian ..
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[Guide] How to Predict miRNA Target Genes using TargetScan TargetScan is one of the most widely used bioinformatics tools for predicting the biological targets of miRNAs. It searches for sites that match the seed region of each miRNA and provides ranked predictions based on scientific scores. 1. What is TargetScan?Developed by the David Bartel lab, TargetScan provides regularly updated predictions across various species. It is highly regarded for its a..
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2022년 하반기 LG CNS - 1차 면접 후기 LG CNS 필기 합격을 하여 1차 면접을 경험하였습니다. 서류 전형이 발표되고 하루 후, 다음의 문자와 함께 1차 면접에 관한 안내문이 게시되었습니다. 다음과 같이 1차 면접 안내문을 받았습니다. 직무 정보와 면접 일자와 시간 등 여러가지 정보를 알려주었습니다. 코로나로 인해 면접이 줌으로 진행되었기 때문에 사람마다 안내된 시간이 다른 것 같습니다. 그리고 면접 시간이 어떻게 변동될지 모르기 때문에 미리 접속하여 대기하는 것이 좋을 것 같습니다. 추가로, LG CNS에서는 서류에서 사진을 넣지 않고 면접 대상자만 증명사진을 제출하였습니다. 면접은 줌으로 진행되었고, 대략 대기시간 포함 30~40분 정도 진행 되었고, 多:1 면접이었습니다. 실무진 두 분과 인사팀 한 분..
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치아의 이름 및 표기법 [치아 이름] 각 치아의 이름은 '상/하악 - 좌/우측 - 영구치/유치 - 치아 이름'의 순서로 부릅니다. 예를 들면, '상악 우측 중절치', '상악 우측 유중절치'와 같이 부르게 됩니다. 영어로 부르는 경우에는 '(permanent) maxillary right central incisor', 'primary maxillary right central incisor'와 같이 부르고 표기하게 됩니다. 영어와 한글의 순서에 약간의 차이가 있음을 알 수 있습니다. [치아 이름 약호 표시] 치아의 이름은 위에 언급한 것과 같이 불러야 하며, 그 이름은 상당히 길다고 느껴질 수 있습니다. 그래서 이름에 혼동이 올 수도 있으며, 진료 시 진료기록부에 표기하거나 이름을 부르는 시간이 오래 걸리는 등의 불편함도..
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ImageJ를 이용한 이미지 분석: 전처리부터 정량 분석까지 현미경 이미지나 세포 사진을 분석할 때 ImageJ는 연구자들에게 필수적인 도구입니다. 오늘은 데이터의 노이즈를 줄이고, 정확하게 입자를 측정할 수 있는 표준화된 분석 워크플로우를 소개해 드리겠습니다. 1. 이미지 전처리 (노이즈 제거 및 최적화)정확한 수치를 얻기 위해서는 먼저 이미지의 상태를 최적화해야 합니다. 제가 사용한 설정값은 다음과 같습니다.채널 분리 (Split Channels): 다채색 이미지의 경우 분석하고자 하는 채널을 분리합니다. 이번 분석에서는 Green 채널을 사용했습니다.배경 제거 (Subtract Background): 'Rolling ball' 알고리즘을 사용하며, 반지름(Radius)은 50으로 설정하여 불균일한 배경 조명을 제거했습니다.가우시안 블러 (Gaussian ..
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2023년 하반기 지원 후기 - HD현대 2023년 하반기에 HD현대의 공고를 보고 지원을 하게 되었습니다. 당시 공고는 아래와 같았는데, 저는 이 중 그나마 제 전공과 가까웠던 '현대중공업'에서 'DT'직무에 지원을 하였습니다. HD현대의 경우, 전용 홈페이지에서 이력서를 작성한 후 지원을 하게 됩니다. 이 과정에서 제출 전에 이력서 내용을 따로 저장해두지 않으면 다시 열람이 안되기 때문에 주의가 필요합니다. 운이 좋게도, 서류가 통과가 되어 1차 면접을 보게 되었습니다. (서류와 1차 면접 사이의 적성검사 등은 없었던 것으로 기억합니다.) 서류 결과 발표는 '2023년 10월 18일 (수)'에 나왔었습니다. 1차 면접은 직무 면접으로, zoom을 통한 화상 면접으로 진행되었습니다. 진행 시간은 약 45~60분 정도 진행이 되었습니다. ..
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뼈 및 연골 (2) [뼈조직 세포] 뼈 조직을 구성하는 세포는 크게 '뼈발생세포', '뼈모세포', '뼈세포', 그리고 '뼈파괴세포'가 있습니다.뼈발생세포(osteoprogenitor cell)는 중간엽에서 유래(줄기세포 해당)하며, 뼈모세포 분화가 가능합니다. 그리고 뼈속막 등과 같은 뼈의 경계부에 주로 분포합니다.뼈모세포(osteoblast)는 뼈발생과정에서 아교섬유의 합성과 석회염류의 침전을 일으켜 뼈서포를 생성하게 됩니다. 주로 입방형/원주형 세포의 단층배열로 이루어져 있으며, 알칼리성분해효소(석회화 방해 인자 파괴, osteoblast 찾는 마커)를 가지고 있고 유기질/무기질을 일정방향으로 배출합니다. '석회화 → 새로운 뼈조직 발생 → 푹뼈조직 속에 묻힘 → 뼈세포 됨'의 과정을 통해 뼈세포를 형성하게 됩니다.뼈세..
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융선 (ridge) 치아의 치관에서 선 모양으로 솟아 있는 부분을 '융선'이라고 합니다. [교두융선 (cusp ridge)] 견치나 구치의 각 교두정에서 협/설/근/원심측으로 주행하는 융선을 의미합니다. 참고로, 상악 제1대구치의 교두는 4개이고, 하악 제1대구치의 교두는 5개 입니다. [삼각융선 (triangular ridge)] 구치의 주요 교두정에서 교합면의 중심부로 내려오는 삼각형 모양의 융선을 의미합니다. 참고로, 상악 제1소구치의 교두는 2개입니다. 그리고 아래 그림처럼 두 개의 삼각융선이 이어지는 것을 '연합융선'이라고 부르기도 합니다. 또한, 협측 교두(buccal cusp)에서 나오는 설측교두융선(lingual cusp ridge)와 그림의 협측삼각융선(buccal triangular ridge)는..
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