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생물정보학8

STRING - 단백질 상호작용 정보 데이터베이스 [STRING: functional protein association networks] STRING는 알려지거나 예측된 단백질-단백질 상호작용에 대한 데이터베이스를 제공하는 사이트 입니다. 이 상호작용은 직접적인(물리적) 상호작용과 간접적인(기능적) 연관성을 포함하며, 계산 예측, 생물체 간의 지식 이전, 및 다른(주요) 데이터베이스에서 수집된 상호작용에서 비롯된다고 합니다. 단백질-단백질 상호작용 네트워크는 세포 과정의 시스템 수준 이해에 중요한 요소를 제공합니다. 이러한 네트워크는 기능 유전체학 데이터를 필터링하고 평가하며, 단백질의 구조적, 기능적, 진화적 특성을 주석 달기에 유용한 플랫폼을 제공합니다. 예측된 상호작용 네트워크를 탐색하면 미래의 실험 연구 방향을 제시하고 효율적인 상호작용 매핑을.. 2024. 7. 8.
TargetScan - miRNA Target gene 찾기 (생물학적 표적 예측 서버) TargetScan은 생물정보학 분야에서 miRNA(마이크로 RNA)의 생물학적 표적을 예측하는 웹 서버입니다. 이 도구는 각 miRNA의 씨앗 영역(seed region)과 일치하는 부위를 찾아 표적을 예측합니다. (많은 종에 대해, 3'-보상 부위라는 다른 유형의 부위도 식별된다고 합니다.) 이러한 miRNA 표적 예측은 David Bartel 연구실과 Whitehead Institute Bioinformatics and Research Computing Group에 의해 정기적으로 업데이트되고 개선됩니다. TargetScan은 TargetScanHuman, TargetScanMouse, TargetScanFish, TargetScanFly, TargetScanWorm을 포함하며, 인간, 쥐, 제브라.. 2024. 7. 5.
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